Спустя три месяца после событий Resident Evil 2 Клэр Редфилд все еще ищет своего брата Криса. Она проникает в штаб-квартиру корпорации Umbrella в Париже, где ее захватывают и вырубают. Когда она приходит в себя, то обнаруживает, что находится в тюрьме на отдаленном острове. Освобожденная дружелюбным охранником, Клэр сталкивается с рядом проблем. Мало того, что остров атакует неизвестный, так еще и произошла очередная вспышка Т-вируса, и остров заполонили зомби и другие мутировавшие существа. Клэр придется столкнуться не только с нежитью, но и с командиром базы, безумным аристократом, имеющим родственные связи с корпорацией Umbrella и Т-вирусом. И побег с острова - это только начало испытаний Клэр.