Сюжетная линия повторяет события предыдущей игры, где Регина выполняет очередное задание, связанное с объектом, расположенным недалеко от вымышленного Эдвард-Сити, где в результате серьезной аномалии весь город вместе со всеми жителями был перенесен в прошлое, в эпоху динозавров. Реджина отправляется на спасение вместе со своим новым союзником Диланом Мортоном, который имеет странную связь с событиями на острове. В определенные моменты игры игрок переключается между управлением Региной и Диланом.